影片主要讲述了盛世年间，道医林萧和亲传弟子田小邪为了清除恐怖的神秘病毒，解救天下苍生而经历一系列磨难的故事。
一夜前朝国师陵墓被盗，丢失墓中珍宝飞鸢珠，奉命镇守陵墓的锦衣卫天城玩忽职守被治罪，危难之际他向千户大人请求戴罪立功，三日之内必将宝物寻回否则甘受惩罚。天城探查宝物踪迹结识摘星楼花魁，二人几次交锋后天城隐约感觉飞鸢珠的丢失与摘星楼有千丝万缕的关系，但摘星楼与东厂宦官势力有错综复杂的联系，一时间天城对摘星楼束手无策。与此同时六扇门捕头探查城中少女失踪案与天城的飞鸢珠被盗案线索汇聚到了一起，俩人最终判定两起案件都与东厂势力相关。天城和六扇门捕头奉命缉拿督主一场恶战，无奈对方武功高强危难之际花魁挺身而出与督主同归于尽，案件最终真相大白，天城向千户大人复命完成三日戴罪立功之约。
林冲在沧州城外结识了仗义疏财的柴进，在柴庄棒打洪教头为柴进出了一口恶气。到达沧州牢城营后，原本只希望安心服役早日回家与娘子团聚的林冲却发现自己陷入到了一场权力斗争的漩涡中。一边是行事鲁莽，与林冲处事理念不合，处处刁难的牢管梁伯侯；另一边是表面道貌岸然，暗地却贪污腐败的孟主簿。更要命的是死对头陆谦也率领大批高手赶到沧州暗中布下天罗地网随时要置林冲于死地。大雪夜，林冲得知家人被害的噩耗以后，悲愤欲绝，忍无可忍，终于战神附体，在山神庙与众仇人上演了一场人挡杀人，佛挡杀佛的终极决战。
公元前139年，张骞率领百余人组成的使团出使西域，中途遭匈奴截杀，张骞与向导堂邑父沦为阶下囚，被困于匈奴十年之久。这日，张骞与堂邑父正照常奉命测绘地图，却不料偶遇大汉斥候耿乐。两军交战，耿乐被俘，误会张骞已经叛变。张骞与同伴的出逃计划因此被打乱……
明朝末年，在西域某地历代为朝廷出产黄金的大漠之中，老镖师带领镖队，告别了监管采金的官府安大人，押送黄金上路。镖队出发不久就遇见了第一拨前来劫镖的“马匪”，老镖师带领众镖师将其全歼，镖队自身也损失惨重。镖队再次上路，却被马三爷带领的第二波马匪击溃，在老镖师的拼死护卫下，儿子穆儿得以逃脱，镖队全军覆没。穆儿在马匪的追杀中，一条胳膊被砍掉。
