电视剧《国门英雄》讲述了这样一个故事：江汉海关代理关长关汉生（李幼斌饰）与魏庭坚、舒岚（史兰芽饰）夫妇以及张怀兵曾经是同生共死的战友。关汉生因承办“506案”不力被解除职务，异地安排。为了揭开黑幕，他顶着巨大压力重回江汉海关办案，不料却一步步掉入“506案”幕后黑手张怀兵的陷阱，并镗锒入狱。与此同时，关汉生养育了二十八年的儿子关双，在得悉张怀兵才是自己的亲生父亲之后也离开他、重回生父张怀兵身边，对于关汉生的各种致命打击接踵而至，但关汉生的反击却始终没有停止。
阴险狡诈、豪爽睿智，掀起闽东苏区革命风暴。二十年代湘、赣、闽一代土匪、军阀横行，黑恶势力不断壮大，帮派搏杀昏天暗地，争权夺挚。以青龙帮为首的黑暗挚力，鱼肉乡里，搅得湘闽一带民不聊生，后洋一派为了穷苦大众与之针锋相对，殊死相争。性格刚烈的山区好汉詹儒柏在一个偶然的机会，认识了才华横溢的地下党县委书记马力峰，并从此结下始终不渝的友谊。在马力峰的引导下，詹儒柏走上革命道路，并受党的重托，筹建革命武装。在敌重兵压境的严峻局势下，詹儒柏坚韧不拔，临危受命，代理闽东特委书记。他们共同领导创建了闽东工农红军独立师，开展了反“围剿” 斗争。
残酷惨烈的抗美援朝战争，彰显了中华儿女不可动摇的钢铁意志，也让本没有任何交集形同陌路的梁步贵（吴旗 饰）和石峰（吴刚 饰）结下了生死友谊。一别七年，这两个人却经历着不同的悲喜人生。梁因当年掩护石峰而身负重伤，以致于始终和妻子冬柳（李菁菁 饰）未能生养，各种磨难让冬柳的精神崩溃，疯疯癫癫，梁的事业也即将跌入谷底。感慨于战友的遭遇，石峰满心愧疚，于是不顾妻子高晓云（丁柳元 饰）的反对，将刚出生不久的儿子送给了梁步贵，这一决定让他迎来了长达四十年的夫妻冷战以及生活的磨难。 在此后的岁月里，这群平凡而赤诚的普通人随着古老国度兴衰起承而沉浮……
胡八一（阮经天 饰）出国在即，整理旧物时翻出一张老照片。那时，他和胖子（刘潮 饰）正作为知青在大兴安岭的山区插队。山里的生活让年轻气盛的他们如鱼得水，为了换几斤水果糖，上山打黄皮子（黄鼠狼），为了给人治病捉熊取胆，没想到二人误入一座坍塌的黄皮子祠。传说几十年前，一伙号称 “泥 儿会”的胡匪曾从黄皮子祠挖出一口描金嵌玉的箱子，随后这伙胡匪和箱子就一起消失在了漠北草原。 此时，恰逢战友丁思甜（郝好 饰）来信邀请他们去草原做客，二人欣然前往，哪知正赶上牧牛受惊。为寻找丢失的牧牛，三人和牧民老羊皮进入俗称阎王殿的百眼窟。在这里，竟有一些日本“给水部队”的遗迹，一座没有房间的怪楼，一个编号是“0”的地下室。更可怕的是，两只全身白毛的黄皮子一直尾随着他们……
抗日战争时期 ﹐日本制定了一系列恶毒的计划﹐妄图陷害抗日的中国将领﹐企图发动太平洋战争﹐并暗地寻找中国的铀矿资源﹐为制造原子弹作准备。打入敌人内部的袁飞﹐被组织怀疑为叛徒﹐他利用聪明才智证明自己的清白﹐他和在他被解救之下加入中国共产党的侠女欧阳雯﹐国民党军统上海站领袖申剑﹐以及来自苏联和世界的反法西斯联盟特工并肩战斗﹐破坏了日军的“920计划”﹑“海计划”﹐并最终取得了日军制造原子弹的426秘密档案。欧阳雯在执行任务的过程中发现了自己的身世﹐她与自己的生母﹑化名梅若兰的日本特务刀枪相对﹐在国恨家仇与骨肉亲情的抉择中﹐她毅然选择了民族大义﹐却遭到梅若兰的枪杀﹐壮烈牺牲。袁飞最后也将隐藏在共产党高层潘和平身边的日本特务华广奇就地正法。
