一九四五年夏，日本法西斯面临彻底覆灭的命运，面对百万苏军压境，侵华日军垂死抵抗，企图使用生化武器来挽救自己的命运， 计划并实施“关东军特别防务演习”。 苏联红军远东八十八旅——抗联教导旅得到情报后，派出以外号“一个团”的抗联英雄焦土为队长，生化武器专家达妮娅、爆破专家黑子、神枪手宝日娜、译员沈若飞和报务员小不点儿等人组成的特别小分队，潜入中国边境，要在大反攻之前，捣毁日军的生化武器库。
喧嚣吵闹的都市一隅，不起眼的角落里，经营着一家从午夜十二点到次日七点营业的小饭馆，被人称作深夜食堂。食堂的菜单仅有大锅菜、啤酒和白酒三样，当然如果客人有什么需要，老板也会专门为他们烹制。食堂的老板（黄磊 饰）不苟言笑，却用一颗温暖真诚的心对待每一位走入食堂的客人。白天，都市男女或者光鲜亮丽，或者狼狈畏缩。到了夜晚，他们便逐一卸去一天的伪装，坐在食堂的角落里，吃喝谈笑，插科打诨，吐槽着坎坷的人生和不公的命运，满身是血双目含泪却仍憧憬未知但可能美好的未来。深夜食堂，是为每一个全力而行的人们喘息疗伤的绿岛…… 本片根据日本同名日剧翻拍而成。
