京城，药铺秦草堂当家秦重楼和大将军云子龙同时向皇上请旨，求赐婚莫家医馆的女儿，但莫家有嫡女莫静妤和庶女莫半夏二人，皇上下旨让他们抽福袋娶亲：抽到谁就和谁成亲。秦重楼身患腿疾，他听闻莫静妤医术高明，期盼她能治好自己。而云子龙身负血海深仇，云父当年运送军资药材出现纰漏，全家获罪，他是唯一幸存者，而那批药材正是莫家医馆的莫襄送来的，他听闻莫襄偏爱莫半夏，想通过她掌握当年莫襄陷害云家的证据，为全家报仇。为了娶对人，秦重楼买通人对福袋做了手脚，谁知天不遂人愿，福袋还是抽错了：秦重楼与莫半夏成亲，云子龙入赘莫静妤。两对不情不愿的新人开启了婚姻生活，婚后生活发现原是良配....
1940年春，中共地下党员、青年医生覃克源（黄觉饰）受重庆政府指派赴国民湖北省政府所在地恩施创办伤兵医院。到恩施后不久，国内形势急骤恶化，国共合作破裂。在接到组织“长期隐蔽”的命令之后，覃克源不顾个人安危，仍然只身坚持战斗。在对日特的一系列斗争中，覃克源处于日本特务、国民党反共势力、家族纷争、爱情纠葛等错综复杂的矛盾之中，彰显出一名共产主义战士高尚的人格魅力。这是一个洋溢着生命激情的男人，一名医术高超的优秀医务工作者，一位坚定的共产主义战士。在他的引导下，麦苏苏、田斯文等一批青年一步一步走上革命道路。
该剧将 故事背景设定在1939年春，讲述了中 共党员、苏军远东情报局上校情报官 苏文执行“尖刀行动”的故事，围绕着 一个事关全军性命的密码机展开，展 现了那个特殊年代里的风云变化以及 各派人马为其付出的惨重代价。
《惊情48小时》全剧四个不同类型的案件组成，分别拟了四个小片目，“红舞之夜”“黑色通道”“神人龙面”和“死亡游戏”。“红舞之夜”剧循着一个年逾三十的舞蹈演员因爱情、事业的挫折而走向绝境的行迹，揭示了一桩看似谋杀，实为自杀的充满悬疑的案件；“黑”剧则跟踪一条毒品走私和贩卖的线索，使形形色色的犯罪嫌疑人浮出水面，而真正的幕后元凶却令人始料不及。
