喧嚣吵闹的都市一隅，不起眼的角落里，经营着一家从午夜十二点到次日七点营业的小饭馆，被人称作深夜食堂。食堂的菜单仅有大锅菜、啤酒和白酒三样，当然如果客人有什么需要，老板也会专门为他们烹制。食堂的老板（黄磊 饰）不苟言笑，却用一颗温暖真诚的心对待每一位走入食堂的客人。白天，都市男女或者光鲜亮丽，或者狼狈畏缩。到了夜晚，他们便逐一卸去一天的伪装，坐在食堂的角落里，吃喝谈笑，插科打诨，吐槽着坎坷的人生和不公的命运，满身是血双目含泪却仍憧憬未知但可能美好的未来。深夜食堂，是为每一个全力而行的人们喘息疗伤的绿岛…… 本片根据日本同名日剧翻拍而成。
常亮自幼双目失明，家人及村里人被日寇全部杀害，无依无靠的小常亮只好四处乞讨流浪。后小常亮幸遇良师学习三弦，从此以弹唱为生，漂泊天涯。一次偶然机会常亮到张家弹唱，奇迹般治好了张家女儿小碧玉日夜啼哭的怪病，可惜在弹唱中途弦断视为不吉，被赶出张家。十六年后，长大成人的常亮和张碧玉偶然重逢，他不忍拖累碧玉而婉拒她的爱慕。
民国初年，海外归来的学子丁云齐作为可以开启昆仑墟宝藏的唯一传承人，一踏进上海便成为多方势力关注的焦点，一时间杀机四伏，敌友难分。外有政府要员、军阀的威逼利诱，内有五门叛徒的图谋暗算，丁云齐多次遭受迫害身陷绝境，但每一次死里逃生之后都更加坚定了他保护昆仑墟免落贼人之手的决心。所幸丁云齐也因此结交了一帮志同道合的朋友，越来越多和丁云齐一样满怀报国兴邦志愿的正义之士在丁云齐的带领下，加入了守护昆仑墟的队伍，一同携手摧毁僵化封建观念的桎梏、腐朽的传统、乃至混乱民国的不正之风。他们相信丁云齐一定会找到昆仑墟，并将它交给新中国。
