「超能力開發研究所」突然遭到無數不明生命體的攻擊，研究所已經完全被破壞殆盡。混亂中，原本在研究所中被實驗的超能力者小雷(10歲)與紗綾香(12歲)趁隙逃了出來。數月之後，不明生命體的政擊再度出現，這次的目標竟然是紗綾香，翔一聞訊之後立即變身為假面騎士顎門，與G3-X一同前住救援。突然間，G4出現了，他的出現讓眾人非常驚訝。因為在兩個月前，G4的藍圖被盜，它的力量強大，但是穿戴它的人往往受不了而致命，到底是誰偷走G4後又製造它？不明生命體的攻擊到底來自何方？假面騎士顎門，G3-X，G4與不明生命體之間的戰爭即將開打！！
宋安原是一名刚毕业不久的大学生，阴差阳错进了一家黑心游戏公司成为了程序员，负责为项目修改BUG。为了完成黑心老板下达的不可能完成的任务，宋安不得不将一些BUG改成彩蛋，确保游戏能够上线。然而宋安在公司依旧备受嘲讽和欺凌，为了还清贷款他只能默默忍受，希冀着这样的生活可以结束。 然而在游戏上线的当天，意外降临，身边的世界竟然成为了自己参与开发的游戏世界！宋安利用对于游戏架构的认知，发现自己居然可以反复刷新游戏身份，就此，“新世界”为他敞开了大门！
作为一个四年前从学校退学之后就一直靠啃老来过活的死宅男佐藤达广（小泉豊 配音）来说，今天也是家里蹲的一天。突然间，一阵敲门声打破了他的日常妄想。打开门，出现在门口的美少女让佐藤简直不敢相信自己的眼睛，而美少女说出的话也让佐藤吃惊的说不出话来。原来，少女名叫中原岬（牧野由 依 配音），自称是“日本废柴协会”的成员，而她此行到来的目的，正是帮助佐藤重新振作，脱离废柴的行列。 一直住在隔壁的动漫美少女控山崎薰（坂口大助 配音）也是协会的一员？进入协会的首要任务就是制作H游戏？口口声声要帮助自己的中原自己也是一个只有靠帮助他人才能找到存在感的废柴？诸多事件的发生让佐藤渐渐开始怀疑，这个所谓的协会，很有可能是一个阴谋。
