故事发生在虚构的未来世界，彼时，人类因为疏忽和大意而失去了制海权，海洋，成为了人们可望而不可即的所在，盘踞在那里的，是一股名为“深海栖舰”的强大势力。为了同这股势力抗争，一群名为“舰娘”的女孩子们出现了，在她们的体内，栖息着舰艇之魂，亦是明日呢化身成为各式各样的战舰，为了人类的和平做着不懈的努力。 平日里，舰娘们在名为“镇守府”的大本营里进行日常生活和训练，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的活泼女孩出现在了大家的面前，初来乍到的她踌躇满志，热情满满地加入了舰队的新生活中去，在这里，充满了精彩和刺激的日常就此展开。
「超能力開發研究所」突然遭到無數不明生命體的攻擊，研究所已經完全被破壞殆盡。混亂中，原本在研究所中被實驗的超能力者小雷(10歲)與紗綾香(12歲)趁隙逃了出來。數月之後，不明生命體的政擊再度出現，這次的目標竟然是紗綾香，翔一聞訊之後立即變身為假面騎士顎門，與G3-X一同前住救援。突然間，G4出現了，他的出現讓眾人非常驚訝。因為在兩個月前，G4的藍圖被盜，它的力量強大，但是穿戴它的人往往受不了而致命，到底是誰偷走G4後又製造它？不明生命體的攻擊到底來自何方？假面騎士顎門，G3-X，G4與不明生命體之間的戰爭即將開打！！
舞台是传说中的大陆“三璃纱”，高达们驰骋于此战乱的时代！ “当三璃纱被黑暗包围之时，拥有三侯灵魂的的高达以将会被圣印玉玺所引导，在此将黑暗驱散…”——取之三璃纱神话《G记》 在传说中的大陆“三璃纱”，暴虐的太师董卓扎古暗杀了当时的皇帝，夺取了皇帝的证明圣印玉玺，成为了三璃纱大陆的新支配者。 现在三璃纱大陆被黑暗所包围。 这时候站起来的是继承神话的三人光芒四射的高达！ 1人是“继承龙帝”的刘备高达！ 1人是“红莲的霸将军”曹操高达！ 1人是“寂静的猛虎”孙权高达！ 这是一部讲述在乱世之中如同太阳般耀眼而且如梦如幻的男人们的战斗物语！
作为一个四年前从学校退学之后就一直靠啃老来过活的死宅男佐藤达广（小泉豊 配音）来说，今天也是家里蹲的一天。突然间，一阵敲门声打破了他的日常妄想。打开门，出现在门口的美少女让佐藤简直不敢相信自己的眼睛，而美少女说出的话也让佐藤吃惊的说不出话来。原来，少女名叫中原岬（牧野由 依 配音），自称是“日本废柴协会”的成员，而她此行到来的目的，正是帮助佐藤重新振作，脱离废柴的行列。 一直住在隔壁的动漫美少女控山崎薰（坂口大助 配音）也是协会的一员？进入协会的首要任务就是制作H游戏？口口声声要帮助自己的中原自己也是一个只有靠帮助他人才能找到存在感的废柴？诸多事件的发生让佐藤渐渐开始怀疑，这个所谓的协会，很有可能是一个阴谋。
Out at sea, the campers see sunny skies - then discover a stowaway on board. A surprise attack from the deep leaves them stranded on un
